凉水河干流综合整治工程范围从北京西客站东侧莲花河暗涵出口~旧宫桥下游北京经济技术开发区1号橡胶坝，总长19.31km。治理河段的上游人民渠、新开渠西四环路以上已于2003年进行了清淤治理，新开渠西四环路以下正在进行综合整治，治理河段下游的北京市经济技术开发区河段，也已在2002~2003年按95规划进行了治理。凉水河干流综合治理工程的上段（莲花河暗涵出口~大红门闸段，河道长10.88km）为北京市政府2004年为群众生活拟办的56件实事之一。
        工程治理目标是还清河道水质，提高河道防洪排水能力，恢复河道生态，绿化、美化环境。
        主要工程内容：河道治理总长19.313km（其中大红门闸以上10.88km），对河道进行展宽疏挖、清淤，以生态方式进行河坡护砌。新建规划雨水口12座，改建现状雨水口268座。新建万泉寺、洋桥橡胶坝2座，改扩建大红门闸1座。新建暗涵出口景观涧石跌水1座。由于河底降低及河道扩宽需要改建人行桥3座、改建顺河桥3座、防护铁路桥5座，防护现状公路桥8座，总计19座。河道两岸新建和恢复巡河路36.5km。河道管理范围内绿化美化面积 27.30万m2。对因为河底降低、河道扩宽需要对的穿河上水、电信、热力、天然气、电力、雨污水等管线进行改移，共40处。河道沿线安装水质监测仪3套，水位流量仪4套。在凉水河管理处实现对二个橡胶坝及一座水闸的远程集中控制。